Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIREO43918 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIREO43918 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIREO43918 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AIREO43918 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AIREO43918 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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