Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE40O14503 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms