Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms