Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms