Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H5

SNCAIP, Synphilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAIPQ9Y6H5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNCAIPQ9Y6H5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNCAIPQ9Y6H5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNCAIPQ9Y6H5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SNCAIPQ9Y6H5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNCAIPQ9Y6H5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNCAIPQ9Y6H5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNCAIPQ9Y6H5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNCAIPQ9Y6H5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNCAIPQ9Y6H5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNCAIPQ9Y6H5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNCAIPQ9Y6H5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNCAIPQ9Y6H5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNCAIPQ9Y6H5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNCAIPQ9Y6H5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNCAIPQ9Y6H5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNCAIPQ9Y6H5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNCAIPQ9Y6H5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNCAIPQ9Y6H5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNCAIPQ9Y6H5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNCAIPQ9Y6H5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms