Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00312Q9Y6C7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00312Q9Y6C7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00312Q9Y6C7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00312Q9Y6C7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00312Q9Y6C7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00312Q9Y6C7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00312Q9Y6C7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00312Q9Y6C7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00312Q9Y6C7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00312Q9Y6C7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00312Q9Y6C7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00312Q9Y6C7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00312Q9Y6C7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00312Q9Y6C7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00312Q9Y6C7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00312Q9Y6C7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00312Q9Y6C7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00312Q9Y6C7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms