Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KPTNQ9Y664 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KPTNQ9Y664 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KPTNQ9Y664 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms