Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX13Q9Y5W8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX13Q9Y5W8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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