Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CTDP1Q9Y5B0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTDP1Q9Y5B0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms