Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED3Q9Y3Q3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMED3Q9Y3Q3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms