Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C5

RNF11, RING finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF11Q9Y3C5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF11Q9Y3C5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF11Q9Y3C5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.7 ms