Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y345

SLC6A5, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A5Q9Y345 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A5Q9Y345 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A5Q9Y345 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A5Q9Y345 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A5Q9Y345 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A5Q9Y345 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A5Q9Y345 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A5Q9Y345 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A5Q9Y345 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A5Q9Y345 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A5Q9Y345 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A5Q9Y345 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A5Q9Y345 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC6A5Q9Y345 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A5Q9Y345 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A5Q9Y345 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A5Q9Y345 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A5Q9Y345 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A5Q9Y345 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A5Q9Y345 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A5Q9Y345 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A5Q9Y345 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A5Q9Y345 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A5Q9Y345 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A5Q9Y345 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A5Q9Y345 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms