Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MED16Q9Y2X0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MED16Q9Y2X0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED16Q9Y2X0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms