Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR1DQ9Y2S0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1DQ9Y2S0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms