Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LIPT1Q9Y234 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIPT1Q9Y234 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms