Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIAA1024Q9UPX6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KIAA1024Q9UPX6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIAA1024Q9UPX6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KIAA1024Q9UPX6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KIAA1024Q9UPX6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIAA1024Q9UPX6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms