Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SETD1BQ9UPS6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SETD1BQ9UPS6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SETD1BQ9UPS6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SETD1BQ9UPS6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SETD1BQ9UPS6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SETD1BQ9UPS6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
SETD1BQ9UPS6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
SETD1BQ9UPS6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SETD1BQ9UPS6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SETD1BQ9UPS6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SETD1BQ9UPS6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms