Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC8A2Q9UPR5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC8A2Q9UPR5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms