Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
L1RE1Q9UN81 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
L1RE1Q9UN81 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms