Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BARX2Q9UMQ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BARX2Q9UMQ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms