Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULX5

RNF112, RING finger protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF112Q9ULX5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF112Q9ULX5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF112Q9ULX5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF112Q9ULX5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF112Q9ULX5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF112Q9ULX5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF112Q9ULX5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF112Q9ULX5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128 ms