Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SARDHQ9UL12 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARDHQ9UL12 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SARDHQ9UL12 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms