Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM4Q9UKN5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM4Q9UKN5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM4Q9UKN5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms