Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP3Q9UKI2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP3Q9UKI2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms