Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSR3Q9UJK0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR3Q9UJK0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms