Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEFF2Q9UIK5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEFF2Q9UIK5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms