Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HERC5Q9UII4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HERC5Q9UII4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERC5Q9UII4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HERC5Q9UII4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms