Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCSK1NQ9UHG2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCSK1NQ9UHG2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCSK1NQ9UHG2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms