Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGK8

SERGEF, Secretion-regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEFQ9UGK8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERGEFQ9UGK8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SERGEFQ9UGK8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms