Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REV1Q9UBZ9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REV1Q9UBZ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
REV1Q9UBZ9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REV1Q9UBZ9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REV1Q9UBZ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms