Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN8Q9UBY8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms