Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK4Q9UBT3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DKK4Q9UBT3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms