Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM4

OPTC, Opticin, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTCQ9UBM4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OPTCQ9UBM4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPTCQ9UBM4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms