Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GALPQ9UBC7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GALPQ9UBC7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms