Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CGNQ9P2M7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNQ9P2M7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms