Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms