Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGFRNQ9P2B2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGFRNQ9P2B2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGFRNQ9P2B2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGFRNQ9P2B2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGFRNQ9P2B2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGFRNQ9P2B2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms