Protein–RNA interactions for Protein: Q9P086

MED11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED11Q9P086 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED11Q9P086 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED11Q9P086 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED11Q9P086 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms