Protein–RNA interactions for Protein: Q9P032

NDUFAF4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF4Q9P032 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF4Q9P032 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF4Q9P032 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF4Q9P032 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms