Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ09

UBAP1, Ubiquitin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1Q9NZ09 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP1Q9NZ09 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms