Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL5

CYP39A1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP39A1Q9NYL5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP39A1Q9NYL5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP39A1Q9NYL5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYP39A1Q9NYL5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CYP39A1Q9NYL5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYP39A1Q9NYL5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CYP39A1Q9NYL5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms