Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY37

ASIC5, Acid-sensing ion channel 5, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC5Q9NY37 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC5Q9NY37 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC5Q9NY37 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC5Q9NY37 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC5Q9NY37 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC5Q9NY37 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC5Q9NY37 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASIC5Q9NY37 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC5Q9NY37 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC5Q9NY37 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC5Q9NY37 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms