Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXX6

NSMCE4A, Non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE4AQ9NXX6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE4AQ9NXX6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE4AQ9NXX6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE4AQ9NXX6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMCE4AQ9NXX6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NSMCE4AQ9NXX6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE4AQ9NXX6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE4AQ9NXX6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE4AQ9NXX6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE4AQ9NXX6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE4AQ9NXX6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE4AQ9NXX6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE4AQ9NXX6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms