Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALKBH4Q9NXW9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALKBH4Q9NXW9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms