Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDE1Q9NXR1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDE1Q9NXR1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDE1Q9NXR1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms