Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX14

NDUFB11, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB11Q9NX14 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDUFB11Q9NX14 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFB11Q9NX14 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFB11Q9NX14 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFB11Q9NX14 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFB11Q9NX14 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFB11Q9NX14 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFB11Q9NX14 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFB11Q9NX14 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFB11Q9NX14 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFB11Q9NX14 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFB11Q9NX14 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFB11Q9NX14 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFB11Q9NX14 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFB11Q9NX14 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFB11Q9NX14 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFB11Q9NX14 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms