Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ECHDC1Q9NTX5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ECHDC1Q9NTX5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ECHDC1Q9NTX5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms