Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBQLN4Q9NRR5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBQLN4Q9NRR5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBQLN4Q9NRR5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBQLN4Q9NRR5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBQLN4Q9NRR5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBQLN4Q9NRR5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms