Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
TULP4Q9NRJ4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TULP4Q9NRJ4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
TULP4Q9NRJ4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TULP4Q9NRJ4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms