Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH2B1Q9NRF2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SH2B1Q9NRF2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms